Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DEUP1Q05D60 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms