Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
E2F1Q01094 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms