Protein–RNA interactions for Protein: P84085

ARF5, ADP-ribosylation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF5P84085 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF5P84085 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF5P84085 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF5P84085 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ARF5P84085 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF5P84085 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF5P84085 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF5P84085 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF5P84085 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF5P84085 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF5P84085 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF5P84085 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF5P84085 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF5P84085 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF5P84085 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF5P84085 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF5P84085 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF5P84085 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF5P84085 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF5P84085 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF5P84085 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF5P84085 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF5P84085 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF5P84085 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF5P84085 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF5P84085 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF5P84085 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF5P84085 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF5P84085 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF5P84085 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF5P84085 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF5P84085 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF5P84085 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF5P84085 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF5P84085 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF5P84085 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF5P84085 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF5P84085 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF5P84085 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF5P84085 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF5P84085 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF5P84085 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF5P84085 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF5P84085 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF5P84085 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARF5P84085 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF5P84085 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF5P84085 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF5P84085 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF5P84085 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF5P84085 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF5P84085 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF5P84085 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF5P84085 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF5P84085 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF5P84085 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF5P84085 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF5P84085 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF5P84085 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF5P84085 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF5P84085 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF5P84085 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF5P84085 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF5P84085 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF5P84085 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF5P84085 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF5P84085 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF5P84085 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF5P84085 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF5P84085 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF5P84085 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARF5P84085 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARF5P84085 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARF5P84085 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARF5P84085 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARF5P84085 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARF5P84085 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARF5P84085 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARF5P84085 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARF5P84085 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARF5P84085 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARF5P84085 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARF5P84085 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARF5P84085 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF5P84085 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF5P84085 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF5P84085 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF5P84085 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF5P84085 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF5P84085 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF5P84085 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF5P84085 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF5P84085 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF5P84085 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF5P84085 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF5P84085 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF5P84085 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF5P84085 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF5P84085 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF5P84085 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms