Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFI35P80217 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IFI35P80217 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFI35P80217 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFI35P80217 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFI35P80217 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFI35P80217 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFI35P80217 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFI35P80217 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFI35P80217 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFI35P80217 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFI35P80217 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFI35P80217 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFI35P80217 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFI35P80217 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFI35P80217 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFI35P80217 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFI35P80217 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFI35P80217 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFI35P80217 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFI35P80217 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFI35P80217 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFI35P80217 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFI35P80217 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFI35P80217 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFI35P80217 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFI35P80217 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFI35P80217 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFI35P80217 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFI35P80217 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFI35P80217 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFI35P80217 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFI35P80217 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFI35P80217 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFI35P80217 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IFI35P80217 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFI35P80217 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IFI35P80217 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IFI35P80217 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFI35P80217 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFI35P80217 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFI35P80217 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFI35P80217 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFI35P80217 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFI35P80217 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFI35P80217 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFI35P80217 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFI35P80217 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFI35P80217 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFI35P80217 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFI35P80217 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFI35P80217 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IFI35P80217 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFI35P80217 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFI35P80217 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFI35P80217 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFI35P80217 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFI35P80217 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFI35P80217 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFI35P80217 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFI35P80217 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFI35P80217 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFI35P80217 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFI35P80217 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFI35P80217 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFI35P80217 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFI35P80217 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFI35P80217 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFI35P80217 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFI35P80217 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFI35P80217 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFI35P80217 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFI35P80217 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFI35P80217 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFI35P80217 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFI35P80217 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFI35P80217 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFI35P80217 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFI35P80217 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFI35P80217 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFI35P80217 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
IFI35P80217 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFI35P80217 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFI35P80217 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFI35P80217 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFI35P80217 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFI35P80217 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFI35P80217 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFI35P80217 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFI35P80217 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFI35P80217 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFI35P80217 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFI35P80217 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFI35P80217 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
IFI35P80217 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IFI35P80217 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IFI35P80217 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IFI35P80217 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
IFI35P80217 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IFI35P80217 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms