Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN10P78369 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN10P78369 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms