Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4BP68371 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms