Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UFM1P61960 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
UFM1P61960 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UFM1P61960 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UFM1P61960 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UFM1P61960 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UFM1P61960 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UFM1P61960 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UFM1P61960 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UFM1P61960 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UFM1P61960 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UFM1P61960 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
UFM1P61960 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UFM1P61960 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UFM1P61960 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UFM1P61960 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UFM1P61960 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UFM1P61960 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UFM1P61960 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UFM1P61960 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UFM1P61960 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UFM1P61960 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UFM1P61960 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UFM1P61960 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UFM1P61960 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UFM1P61960 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UFM1P61960 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UFM1P61960 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
UFM1P61960 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UFM1P61960 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
UFM1P61960 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UFM1P61960 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
UFM1P61960 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UFM1P61960 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UFM1P61960 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UFM1P61960 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
UFM1P61960 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UFM1P61960 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
UFM1P61960 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UFM1P61960 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UFM1P61960 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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