Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MCCD1P59942 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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