Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHBDL3P58872 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHBDL3P58872 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHBDL3P58872 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHBDL3P58872 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHBDL3P58872 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHBDL3P58872 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHBDL3P58872 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHBDL3P58872 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHBDL3P58872 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHBDL3P58872 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHBDL3P58872 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHBDL3P58872 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHBDL3P58872 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHBDL3P58872 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHBDL3P58872 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHBDL3P58872 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHBDL3P58872 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHBDL3P58872 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHBDL3P58872 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHBDL3P58872 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDL3P58872 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms