Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCNN1GP51170 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCNN1GP51170 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCNN1GP51170 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCNN1GP51170 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCNN1GP51170 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCNN1GP51170 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCNN1GP51170 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCNN1GP51170 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCNN1GP51170 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCNN1GP51170 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCNN1GP51170 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCNN1GP51170 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCNN1GP51170 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCNN1GP51170 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCNN1GP51170 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCNN1GP51170 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCNN1GP51170 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCNN1GP51170 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCNN1GP51170 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCNN1GP51170 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCNN1GP51170 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCNN1GP51170 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCNN1GP51170 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCNN1GP51170 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCNN1GP51170 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCNN1GP51170 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCNN1GP51170 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCNN1GP51170 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCNN1GP51170 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCNN1GP51170 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCNN1GP51170 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCNN1GP51170 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCNN1GP51170 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCNN1GP51170 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCNN1GP51170 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SCNN1GP51170 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCNN1GP51170 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCNN1GP51170 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCNN1GP51170 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms