Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLCSP50747 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLCSP50747 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLCSP50747 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HLCSP50747 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLCSP50747 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLCSP50747 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLCSP50747 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLCSP50747 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HLCSP50747 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLCSP50747 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HLCSP50747 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLCSP50747 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLCSP50747 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLCSP50747 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLCSP50747 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLCSP50747 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLCSP50747 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLCSP50747 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLCSP50747 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLCSP50747 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLCSP50747 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLCSP50747 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLCSP50747 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLCSP50747 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLCSP50747 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLCSP50747 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLCSP50747 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLCSP50747 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLCSP50747 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLCSP50747 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLCSP50747 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLCSP50747 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLCSP50747 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLCSP50747 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLCSP50747 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLCSP50747 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLCSP50747 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLCSP50747 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLCSP50747 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLCSP50747 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLCSP50747 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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HLCSP50747 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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HLCSP50747 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLCSP50747 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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HLCSP50747 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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HLCSP50747 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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HLCSP50747 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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HLCSP50747 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLCSP50747 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLCSP50747 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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HLCSP50747 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLCSP50747 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLCSP50747 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLCSP50747 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLCSP50747 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLCSP50747 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLCSP50747 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLCSP50747 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLCSP50747 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLCSP50747 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HLCSP50747 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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