Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF6P49848 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF6P49848 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF6P49848 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF6P49848 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF6P49848 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF6P49848 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF6P49848 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF6P49848 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF6P49848 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF6P49848 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF6P49848 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF6P49848 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF6P49848 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF6P49848 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF6P49848 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF6P49848 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF6P49848 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF6P49848 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF6P49848 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF6P49848 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF6P49848 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF6P49848 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF6P49848 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF6P49848 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF6P49848 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF6P49848 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF6P49848 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF6P49848 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF6P49848 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF6P49848 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF6P49848 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF6P49848 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF6P49848 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF6P49848 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF6P49848 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF6P49848 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF6P49848 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF6P49848 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF6P49848 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF6P49848 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF6P49848 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF6P49848 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF6P49848 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF6P49848 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF6P49848 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF6P49848 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF6P49848 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF6P49848 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF6P49848 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF6P49848 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF6P49848 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF6P49848 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF6P49848 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF6P49848 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF6P49848 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF6P49848 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF6P49848 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF6P49848 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF6P49848 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF6P49848 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF6P49848 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF6P49848 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF6P49848 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF6P49848 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF6P49848 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF6P49848 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF6P49848 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF6P49848 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF6P49848 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF6P49848 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF6P49848 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF6P49848 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF6P49848 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF6P49848 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF6P49848 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF6P49848 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF6P49848 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF6P49848 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF6P49848 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF6P49848 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF6P49848 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF6P49848 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF6P49848 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF6P49848 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF6P49848 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF6P49848 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF6P49848 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF6P49848 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF6P49848 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF6P49848 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF6P49848 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF6P49848 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF6P49848 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF6P49848 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF6P49848 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF6P49848 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF6P49848 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF6P49848 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF6P49848 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms