Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1DP48730 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1DP48730 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1DP48730 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1DP48730 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1DP48730 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1DP48730 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1DP48730 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1DP48730 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1DP48730 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1DP48730 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1DP48730 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1DP48730 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1DP48730 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1DP48730 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1DP48730 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1DP48730 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1DP48730 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1DP48730 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1DP48730 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1DP48730 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1DP48730 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1DP48730 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1DP48730 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1DP48730 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1DP48730 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1DP48730 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1DP48730 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1DP48730 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1DP48730 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1DP48730 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1DP48730 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1DP48730 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1DP48730 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1DP48730 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1DP48730 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1DP48730 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1DP48730 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1DP48730 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1DP48730 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK1DP48730 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK1DP48730 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CSNK1DP48730 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK1DP48730 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK1DP48730 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK1DP48730 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK1DP48730 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK1DP48730 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK1DP48730 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK1DP48730 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK1DP48730 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms