Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMD8P48556 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD8P48556 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD8P48556 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD8P48556 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD8P48556 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD8P48556 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD8P48556 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD8P48556 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD8P48556 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD8P48556 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD8P48556 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD8P48556 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD8P48556 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD8P48556 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD8P48556 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD8P48556 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD8P48556 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD8P48556 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD8P48556 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD8P48556 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD8P48556 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD8P48556 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD8P48556 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD8P48556 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD8P48556 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD8P48556 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD8P48556 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD8P48556 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD8P48556 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD8P48556 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD8P48556 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD8P48556 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD8P48556 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD8P48556 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD8P48556 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD8P48556 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD8P48556 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMD8P48556 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMD8P48556 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms