Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA8P48165 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA8P48165 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA8P48165 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA8P48165 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA8P48165 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA8P48165 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA8P48165 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA8P48165 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA8P48165 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA8P48165 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA8P48165 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA8P48165 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA8P48165 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA8P48165 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA8P48165 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA8P48165 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA8P48165 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA8P48165 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA8P48165 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA8P48165 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA8P48165 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA8P48165 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA8P48165 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA8P48165 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA8P48165 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GJA8P48165 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA8P48165 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA8P48165 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA8P48165 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA8P48165 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA8P48165 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA8P48165 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA8P48165 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA8P48165 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA8P48165 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA8P48165 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA8P48165 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA8P48165 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA8P48165 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA8P48165 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA8P48165 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA8P48165 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA8P48165 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA8P48165 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA8P48165 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA8P48165 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA8P48165 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA8P48165 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA8P48165 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA8P48165 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA8P48165 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA8P48165 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA8P48165 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA8P48165 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA8P48165 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GJA8P48165 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GJA8P48165 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GJA8P48165 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
GJA8P48165 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GJA8P48165 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GJA8P48165 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GJA8P48165 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GJA8P48165 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GJA8P48165 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
GJA8P48165 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GJA8P48165 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA8P48165 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA8P48165 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA8P48165 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA8P48165 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA8P48165 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA8P48165 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA8P48165 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA8P48165 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA8P48165 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA8P48165 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA8P48165 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA8P48165 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA8P48165 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA8P48165 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA8P48165 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA8P48165 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA8P48165 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA8P48165 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA8P48165 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA8P48165 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA8P48165 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA8P48165 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA8P48165 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA8P48165 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA8P48165 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA8P48165 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA8P48165 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA8P48165 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA8P48165 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA8P48165 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA8P48165 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA8P48165 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA8P48165 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms