Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ME1P48163 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ME1P48163 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ME1P48163 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ME1P48163 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ME1P48163 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ME1P48163 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ME1P48163 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ME1P48163 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ME1P48163 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ME1P48163 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ME1P48163 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ME1P48163 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ME1P48163 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ME1P48163 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ME1P48163 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ME1P48163 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ME1P48163 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ME1P48163 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ME1P48163 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ME1P48163 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ME1P48163 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ME1P48163 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ME1P48163 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ME1P48163 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ME1P48163 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ME1P48163 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ME1P48163 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ME1P48163 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ME1P48163 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ME1P48163 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ME1P48163 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ME1P48163 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ME1P48163 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ME1P48163 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ME1P48163 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ME1P48163 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ME1P48163 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ME1P48163 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ME1P48163 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ME1P48163 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ME1P48163 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ME1P48163 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ME1P48163 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ME1P48163 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ME1P48163 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ME1P48163 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ME1P48163 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ME1P48163 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ME1P48163 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ME1P48163 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ME1P48163 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ME1P48163 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ME1P48163 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ME1P48163 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ME1P48163 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ME1P48163 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ME1P48163 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ME1P48163 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ME1P48163 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ME1P48163 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ME1P48163 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ME1P48163 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ME1P48163 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ME1P48163 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ME1P48163 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ME1P48163 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ME1P48163 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ME1P48163 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ME1P48163 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ME1P48163 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ME1P48163 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ME1P48163 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ME1P48163 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ME1P48163 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ME1P48163 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ME1P48163 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ME1P48163 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ME1P48163 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ME1P48163 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ME1P48163 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ME1P48163 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ME1P48163 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ME1P48163 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ME1P48163 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ME1P48163 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ME1P48163 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ME1P48163 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ME1P48163 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ME1P48163 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ME1P48163 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ME1P48163 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ME1P48163 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ME1P48163 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ME1P48163 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ME1P48163 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ME1P48163 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ME1P48163 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ME1P48163 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ME1P48163 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms