Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ETV4P43268 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ETV4P43268 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ETV4P43268 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ETV4P43268 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ETV4P43268 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ETV4P43268 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ETV4P43268 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ETV4P43268 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ETV4P43268 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ETV4P43268 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ETV4P43268 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ETV4P43268 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ETV4P43268 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ETV4P43268 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ETV4P43268 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ETV4P43268 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ETV4P43268 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ETV4P43268 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ETV4P43268 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ETV4P43268 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ETV4P43268 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ETV4P43268 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ETV4P43268 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ETV4P43268 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ETV4P43268 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ETV4P43268 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ETV4P43268 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ETV4P43268 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ETV4P43268 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ETV4P43268 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ETV4P43268 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ETV4P43268 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ETV4P43268 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ETV4P43268 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ETV4P43268 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ETV4P43268 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ETV4P43268 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ETV4P43268 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ETV4P43268 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ETV4P43268 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ETV4P43268 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ETV4P43268 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ETV4P43268 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ETV4P43268 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ETV4P43268 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ETV4P43268 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ETV4P43268 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ETV4P43268 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ETV4P43268 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ETV4P43268 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ETV4P43268 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ETV4P43268 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ETV4P43268 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ETV4P43268 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ETV4P43268 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ETV4P43268 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ETV4P43268 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ETV4P43268 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ETV4P43268 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ETV4P43268 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ETV4P43268 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ETV4P43268 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ETV4P43268 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ETV4P43268 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ETV4P43268 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ETV4P43268 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ETV4P43268 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ETV4P43268 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ETV4P43268 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ETV4P43268 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ETV4P43268 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ETV4P43268 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ETV4P43268 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ETV4P43268 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ETV4P43268 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ETV4P43268 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ETV4P43268 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ETV4P43268 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ETV4P43268 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ETV4P43268 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ETV4P43268 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ETV4P43268 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ETV4P43268 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ETV4P43268 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ETV4P43268 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ETV4P43268 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ETV4P43268 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ETV4P43268 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ETV4P43268 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ETV4P43268 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ETV4P43268 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ETV4P43268 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ETV4P43268 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ETV4P43268 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ETV4P43268 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ETV4P43268 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ETV4P43268 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ETV4P43268 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ETV4P43268 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms