Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGAEP38570 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms