Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFBP38117 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFBP38117 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFBP38117 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFBP38117 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFBP38117 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFBP38117 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETFBP38117 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFBP38117 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFBP38117 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFBP38117 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFBP38117 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFBP38117 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFBP38117 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFBP38117 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFBP38117 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFBP38117 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFBP38117 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFBP38117 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFBP38117 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFBP38117 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFBP38117 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFBP38117 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFBP38117 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFBP38117 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFBP38117 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFBP38117 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFBP38117 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFBP38117 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFBP38117 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFBP38117 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFBP38117 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFBP38117 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFBP38117 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFBP38117 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFBP38117 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFBP38117 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFBP38117 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFBP38117 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFBP38117 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFBP38117 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFBP38117 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFBP38117 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFBP38117 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFBP38117 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFBP38117 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFBP38117 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFBP38117 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFBP38117 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFBP38117 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFBP38117 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETFBP38117 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFBP38117 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFBP38117 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFBP38117 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFBP38117 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFBP38117 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFBP38117 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFBP38117 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFBP38117 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFBP38117 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFBP38117 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFBP38117 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFBP38117 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFBP38117 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFBP38117 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFBP38117 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFBP38117 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFBP38117 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFBP38117 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFBP38117 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFBP38117 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFBP38117 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFBP38117 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFBP38117 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFBP38117 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFBP38117 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFBP38117 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFBP38117 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFBP38117 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFBP38117 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFBP38117 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFBP38117 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFBP38117 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFBP38117 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFBP38117 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFBP38117 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFBP38117 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFBP38117 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFBP38117 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFBP38117 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFBP38117 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFBP38117 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFBP38117 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFBP38117 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFBP38117 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFBP38117 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFBP38117 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFBP38117 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETFBP38117 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms