Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTNNA1P35221 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms