Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 AC120498.5-201ENST00000561757 299 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms