Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBL1P28749 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBL1P28749 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBL1P28749 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBL1P28749 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBL1P28749 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBL1P28749 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBL1P28749 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBL1P28749 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBL1P28749 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RBL1P28749 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBL1P28749 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBL1P28749 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBL1P28749 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBL1P28749 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBL1P28749 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBL1P28749 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBL1P28749 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBL1P28749 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBL1P28749 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RBL1P28749 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBL1P28749 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBL1P28749 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBL1P28749 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBL1P28749 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBL1P28749 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBL1P28749 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBL1P28749 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBL1P28749 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBL1P28749 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBL1P28749 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBL1P28749 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBL1P28749 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RBL1P28749 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBL1P28749 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RBL1P28749 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBL1P28749 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBL1P28749 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBL1P28749 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms