Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMBRP28336 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMBRP28336 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMBRP28336 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMBRP28336 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMBRP28336 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMBRP28336 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMBRP28336 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NMBRP28336 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NMBRP28336 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMBRP28336 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMBRP28336 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMBRP28336 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NMBRP28336 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMBRP28336 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMBRP28336 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMBRP28336 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NMBRP28336 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NMBRP28336 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NMBRP28336 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NMBRP28336 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMBRP28336 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMBRP28336 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NMBRP28336 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMBRP28336 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NMBRP28336 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMBRP28336 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMBRP28336 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMBRP28336 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMBRP28336 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMBRP28336 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMBRP28336 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMBRP28336 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMBRP28336 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMBRP28336 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMBRP28336 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMBRP28336 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMBRP28336 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMBRP28336 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NMBRP28336 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMBRP28336 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMBRP28336 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMBRP28336 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMBRP28336 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMBRP28336 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMBRP28336 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMBRP28336 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMBRP28336 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMBRP28336 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMBRP28336 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMBRP28336 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMBRP28336 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMBRP28336 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMBRP28336 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMBRP28336 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMBRP28336 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMBRP28336 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMBRP28336 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMBRP28336 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMBRP28336 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMBRP28336 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMBRP28336 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMBRP28336 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NMBRP28336 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMBRP28336 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMBRP28336 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NMBRP28336 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMBRP28336 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMBRP28336 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMBRP28336 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMBRP28336 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMBRP28336 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMBRP28336 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMBRP28336 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMBRP28336 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMBRP28336 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMBRP28336 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMBRP28336 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMBRP28336 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMBRP28336 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMBRP28336 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMBRP28336 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMBRP28336 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMBRP28336 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMBRP28336 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMBRP28336 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMBRP28336 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMBRP28336 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMBRP28336 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMBRP28336 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMBRP28336 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMBRP28336 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMBRP28336 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMBRP28336 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMBRP28336 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMBRP28336 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMBRP28336 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMBRP28336 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMBRP28336 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMBRP28336 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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