Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM21P19474 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM21P19474 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms