Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBTFP17480 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBTFP17480 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBTFP17480 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UBTFP17480 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBTFP17480 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBTFP17480 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBTFP17480 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBTFP17480 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBTFP17480 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBTFP17480 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBTFP17480 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBTFP17480 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBTFP17480 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBTFP17480 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UBTFP17480 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UBTFP17480 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBTFP17480 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBTFP17480 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UBTFP17480 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBTFP17480 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBTFP17480 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBTFP17480 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBTFP17480 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBTFP17480 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBTFP17480 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBTFP17480 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBTFP17480 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBTFP17480 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBTFP17480 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBTFP17480 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBTFP17480 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBTFP17480 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBTFP17480 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBTFP17480 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBTFP17480 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
UBTFP17480 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBTFP17480 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBTFP17480 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBTFP17480 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBTFP17480 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBTFP17480 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBTFP17480 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBTFP17480 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBTFP17480 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBTFP17480 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBTFP17480 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBTFP17480 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBTFP17480 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBTFP17480 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBTFP17480 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBTFP17480 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBTFP17480 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBTFP17480 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBTFP17480 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
UBTFP17480 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBTFP17480 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBTFP17480 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
UBTFP17480 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBTFP17480 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBTFP17480 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBTFP17480 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBTFP17480 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBTFP17480 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBTFP17480 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBTFP17480 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBTFP17480 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBTFP17480 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBTFP17480 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBTFP17480 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBTFP17480 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBTFP17480 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBTFP17480 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBTFP17480 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBTFP17480 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBTFP17480 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBTFP17480 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBTFP17480 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBTFP17480 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBTFP17480 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBTFP17480 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBTFP17480 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
UBTFP17480 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
UBTFP17480 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBTFP17480 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBTFP17480 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBTFP17480 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBTFP17480 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBTFP17480 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBTFP17480 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
UBTFP17480 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBTFP17480 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBTFP17480 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBTFP17480 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBTFP17480 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBTFP17480 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBTFP17480 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBTFP17480 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBTFP17480 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBTFP17480 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms