Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPB42P16452 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPB42P16452 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPB42P16452 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPB42P16452 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPB42P16452 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPB42P16452 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPB42P16452 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPB42P16452 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPB42P16452 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPB42P16452 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPB42P16452 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPB42P16452 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPB42P16452 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPB42P16452 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPB42P16452 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPB42P16452 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPB42P16452 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPB42P16452 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
EPB42P16452 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPB42P16452 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPB42P16452 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPB42P16452 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPB42P16452 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPB42P16452 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPB42P16452 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPB42P16452 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
EPB42P16452 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
EPB42P16452 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPB42P16452 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPB42P16452 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPB42P16452 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPB42P16452 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPB42P16452 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
EPB42P16452 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPB42P16452 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPB42P16452 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPB42P16452 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPB42P16452 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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EPB42P16452 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPB42P16452 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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EPB42P16452 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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EPB42P16452 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPB42P16452 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPB42P16452 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPB42P16452 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPB42P16452 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPB42P16452 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPB42P16452 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPB42P16452 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPB42P16452 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPB42P16452 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPB42P16452 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPB42P16452 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPB42P16452 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPB42P16452 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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EPB42P16452 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPB42P16452 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPB42P16452 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPB42P16452 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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EPB42P16452 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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EPB42P16452 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPB42P16452 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPB42P16452 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPB42P16452 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPB42P16452 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPB42P16452 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
EPB42P16452 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPB42P16452 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPB42P16452 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPB42P16452 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPB42P16452 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPB42P16452 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPB42P16452 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPB42P16452 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
EPB42P16452 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPB42P16452 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPB42P16452 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPB42P16452 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EPB42P16452 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EPB42P16452 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EPB42P16452 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
EPB42P16452 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EPB42P16452 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
EPB42P16452 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EPB42P16452 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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