Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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CTLA4P16410 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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CTLA4P16410 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CTLA4P16410 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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CTLA4P16410 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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