Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXD8P13378 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms