Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
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PTPRCP08575 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
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PTPRCP08575 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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PTPRCP08575 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
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PTPRCP08575 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRCP08575 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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