Protein–RNA interactions for Protein: P02776

PF4, Platelet factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4P02776 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PF4P02776 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PF4P02776 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PF4P02776 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PF4P02776 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PF4P02776 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PF4P02776 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PF4P02776 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PF4P02776 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PF4P02776 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PF4P02776 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PF4P02776 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PF4P02776 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PF4P02776 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PF4P02776 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PF4P02776 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PF4P02776 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PF4P02776 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PF4P02776 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PF4P02776 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PF4P02776 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PF4P02776 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PF4P02776 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PF4P02776 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PF4P02776 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PF4P02776 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PF4P02776 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PF4P02776 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PF4P02776 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PF4P02776 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PF4P02776 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PF4P02776 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PF4P02776 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PF4P02776 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PF4P02776 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PF4P02776 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PF4P02776 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PF4P02776 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PF4P02776 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PF4P02776 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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PF4P02776 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PF4P02776 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PF4P02776 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PF4P02776 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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PF4P02776 BTN3A2-202ENST00000377708 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PF4P02776 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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PF4P02776 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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PF4P02776 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PF4P02776 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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PF4P02776 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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PF4P02776 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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PF4P02776 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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PF4P02776 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PF4P02776 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PF4P02776 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PF4P02776 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PF4P02776 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PF4P02776 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PF4P02776 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PF4P02776 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PF4P02776 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PF4P02776 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PF4P02776 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PF4P02776 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PF4P02776 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PF4P02776 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PF4P02776 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PF4P02776 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PF4P02776 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PF4P02776 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PF4P02776 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PF4P02776 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PF4P02776 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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