Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TOP3BO95985 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TOP3BO95985 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TOP3BO95985 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TOP3BO95985 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TOP3BO95985 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TOP3BO95985 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TOP3BO95985 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TOP3BO95985 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3BO95985 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3BO95985 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3BO95985 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3BO95985 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3BO95985 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3BO95985 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3BO95985 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3BO95985 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3BO95985 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3BO95985 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3BO95985 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3BO95985 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3BO95985 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3BO95985 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms