Protein–RNA interactions for Protein: O95197

RTN3, Reticulon-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN3O95197 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTN3O95197 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTN3O95197 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTN3O95197 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTN3O95197 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTN3O95197 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTN3O95197 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTN3O95197 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTN3O95197 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTN3O95197 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTN3O95197 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTN3O95197 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RTN3O95197 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTN3O95197 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTN3O95197 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTN3O95197 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTN3O95197 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTN3O95197 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTN3O95197 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTN3O95197 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTN3O95197 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTN3O95197 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTN3O95197 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTN3O95197 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTN3O95197 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTN3O95197 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTN3O95197 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTN3O95197 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTN3O95197 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTN3O95197 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTN3O95197 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTN3O95197 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTN3O95197 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTN3O95197 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTN3O95197 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTN3O95197 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RTN3O95197 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTN3O95197 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTN3O95197 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RTN3O95197 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTN3O95197 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RTN3O95197 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTN3O95197 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTN3O95197 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTN3O95197 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTN3O95197 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTN3O95197 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTN3O95197 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTN3O95197 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTN3O95197 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTN3O95197 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTN3O95197 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTN3O95197 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTN3O95197 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RTN3O95197 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTN3O95197 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTN3O95197 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTN3O95197 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTN3O95197 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTN3O95197 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTN3O95197 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RTN3O95197 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTN3O95197 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTN3O95197 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTN3O95197 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTN3O95197 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTN3O95197 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTN3O95197 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTN3O95197 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTN3O95197 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTN3O95197 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTN3O95197 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTN3O95197 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTN3O95197 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTN3O95197 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RTN3O95197 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTN3O95197 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTN3O95197 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTN3O95197 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTN3O95197 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTN3O95197 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTN3O95197 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTN3O95197 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTN3O95197 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTN3O95197 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTN3O95197 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTN3O95197 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTN3O95197 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTN3O95197 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTN3O95197 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTN3O95197 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTN3O95197 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTN3O95197 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTN3O95197 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTN3O95197 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTN3O95197 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTN3O95197 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTN3O95197 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTN3O95197 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTN3O95197 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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