Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKAP2O75563 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.4 ms