Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF208O43345 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF208O43345 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF208O43345 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF208O43345 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF208O43345 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF208O43345 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF208O43345 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF208O43345 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF208O43345 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF208O43345 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF208O43345 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZNF208O43345 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZNF208O43345 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZNF208O43345 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZNF208O43345 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZNF208O43345 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZNF208O43345 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZNF208O43345 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZNF208O43345 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZNF208O43345 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF208O43345 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms