Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms