Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms