Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

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Length 899 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRRT4C9JH25 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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