Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms