Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF879B4DU55 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms