Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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C4orf47A7E2U8 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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C4orf47A7E2U8 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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C4orf47A7E2U8 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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C4orf47A7E2U8 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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C4orf47A7E2U8 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf47A7E2U8 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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