Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms