Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC78A2IDD5 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms