Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
HECTD4Q9Y4D8 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms