Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 393.4 ms