Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y232

CDYL, Chromodomain Y-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDYLQ9Y232 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDYLQ9Y232 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms