Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TNFSF18Q9UNG2 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms