Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.7 ms