Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CYTH4Q9UIA0 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms