Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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