Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms